Балтика Калининград U21 е футболен отбор, базиран в Калининград, Русия. Отборът е част от школата на ФК "Балтика" Калининград.

Балтика Калининград U21 играе в Младежката Първа Дивизия, второто ниво на руския младежки футбол. Отборът е основан през 2013 г. и за първи път се състезава в Младежката Втора Дивизия.

Отборът е постигнал редица успехи, включително спечелването на Младежката Втора Дивизия през 2016 г. и достигането до финала на Младежката Купа на Русия през 2017 г.

Балтика Калининград U21 е известна със своята атакуваща игра и развитието на млади таланти. Отборът е тясно свързан с основния отбор на Балтика Калининград и е служил като трамплин за редица играчи, които са продължили да играят в Премиер лигата на Русия и националния отбор на Русия.